Русский человек начинает читать описание, только когда полностью запутается.
Кроме Proteus-а рекомендую посмотреть и настоятельно рекомендую пользовать AVR Simulator IDE
Для начального освоения удобна тем, что наглядно отображает ВСЕ внутренние регистры микрухи. Хотя по сравнению с PIC Simulator IDE явно не доделана.
В общем посмотри не поленись.