Ардуино - AVR-контроллер с небольшим обвесом.
Если человек дальше применения неких Библиотек от Сообщества Arduino.сс не может продвинутся, то конечно будут проблемы.
Пишите под ардуино на Си/Си++, тем более что сама Arduino IDE лишь транслирует Ардуино-код в Си, а дальше компилируется Си-шный код с помощью GNU-того компилятора из пакета WinAVR (да ещё и старого, 2008г)