вся загвоздка в том, что портирование самый сложный момент с дотнетом. сейчас доступны платы (цены начинаются примерно от 40$) с уже портированым под них .net mf, очень богатыми библиотеками, документацией, постоянной профессиональной поддержкой. с уже сложившимся, пусть и не большим, но уже сообществом. а это хоть какой-то код, обсуждение, допиливания. на создание подобного уйдёт ... сколько времени. вот примерно за такие платки речь
http://www.ghielectronics.com/catalog/product/256,
http://informatix.miloush.net/microframework/HardwareComparisonModules.aspx. есть попроще и подешевле. есть и подороже, но смысла имхо в этом с ростом цены и навороченности платы всё меньше и меньше. для mini2440 (или вы ошиблись с подфорумом для темы?) уже есть и линух и винда, какой смысл под ними запускать mf?
П.С. уже есть подобные начинания, вот хотя бы
http://s3c2440mfport.codeplex.com/. вместо того, чтоб начинать всё с нуля, лучше присоединяйтесь к подобным проектам. +нельзя ограничиваться только этим форумом - тут людей, программирующих на дотнете рас, два и обчёлся.