Да вроде не должно. Правда не помню какие фьюзы нужно для бутлоадера. Потом когда есть бут, можно залить прошивку через I2C. Я писал мелкий скрипт для загрузки используя орфу в качестве шлюза. Лежит с исходниками. Там же скетч для дуины, реализующий гейт uart->i2c с протоколом орфы. Он правда несколько кривоват.