Стабилитрон с ноги на земь, далее резистор 200-500 Ом, затем TVS защитный диод и еще резистор - для большинства сигналов пойдет. i2c надо корректировать.
Если несимметричный TVS на 3,6 вольт найдете то стабилитроне не нужен и резистора 1 достаточно.
Защиту удобно распаять на отдельной плате переходнике или "маме" для RPi
=========
обидно что на таких платах экономят "5 коп" на защите элементарной, при том что есть недорогие чипы защиты сразу на 5 сигнальных линий -
http://www.mkpochtoi.ru - SMF05CT1G в маленьком корпусе SC-88